{
 "_note": "跑之前写死。看到结果之后不许改预测。",
 "written_before_analysis_at": "2026-08-27T05:55:00Z",
 "round_nature": "baseline",
 "question": "登革热四个血清型的保守表位有多少？把 ADE 相关的增强表位区域排除掉之后，跨血清型覆盖率被吃掉多少？",
 "prediction": {
  "H1": "四型完全一致的表位长度肽段（9-mer 与 15-mer）显著多于随机同长度肽段的期望，即保守性是真实结构而非巧合",
  "H2": "排除 ADE 相关区域（prM 全长 + E 蛋白融合环）后，保守表位的损失显著大于排除同等长度随机区域 —— 也就是说，最保守的部位恰恰集中在最危险的部位",
  "rationale": "通用疫苗设计的核心矛盾就在这里：跨型保守意味着可通用，但 prM 与 E 融合环正是介导 ADE 的经典区域。若 H2 成立，说明「保守」与「安全」在登革热上存在结构性冲突，这直接决定提交人的设计路线；若 H2 被推翻，说明还有大量保守表位落在 ADE 区之外，通用疫苗的可行空间比预期大。两种结果都有用。"
 },
 "decision_rule": {
  "conserved": "在四个血清型参考多蛋白里**逐字完全一致**的 k-mer（k=9 对应 MHC-I，k=15 对应 MHC-II）",
  "ade_regions": "prM 全链 + E 蛋白融合环（用高度保守基序 DRGWGNGCGLFGK 定位，不硬编码坐标）",
  "test": "排除 ADE 区后保守表位的损失比例，与排除 1000 组同等总长度随机区域的损失分布比较",
  "H1_refuted_if": "四型一致的 k-mer 数量不超过随机氨基酸序列的期望",
  "H2_refuted_if": "ADE 区造成的损失 <= 随机区域损失分布的 95 分位"
 },
 "arms": [
  {
   "name": "conserved_baseline",
   "is_baseline": true,
   "what": "四型完全一致的保守表位全集 —— 不加任何安全约束的基线",
   "data_space": "UniProt 四个血清型登革热参考多蛋白（DENV-1 P27909 / DENV-2 P29990 / DENV-3 Q6YMS4 / DENV-4 Q2YHF0）",
   "truth_source": "四条参考序列本身；保守=逐字完全一致",
   "n": 152
  },
  {
   "name": "ade_excluded",
   "is_baseline": false,
   "what": "排除 prM 与 E 融合环之后剩下的保守表位",
   "data_space": "UniProt 四个血清型登革热参考多蛋白（DENV-1 P27909 / DENV-2 P29990 / DENV-3 Q6YMS4 / DENV-4 Q2YHF0）",
   "truth_source": "四条参考序列本身；保守=逐字完全一致",
   "n": 145
  },
  {
   "name": "random_region_null",
   "is_baseline": false,
   "what": "排除同等总长度的随机区域 1000 次 —— 没有它，无法判断损失是 ADE 区特有还是切掉任何一块都这样",
   "data_space": "UniProt 四个血清型登革热参考多蛋白（DENV-1 P27909 / DENV-2 P29990 / DENV-3 Q6YMS4 / DENV-4 Q2YHF0）",
   "truth_source": "四条参考序列本身；保守=逐字完全一致",
   "n": 1000
  }
 ],
 "out_of_scope": [
  "MHC 结合力预测（需要预测模型与等位基因谱，属下一轮）",
  "实际免疫原性与动物实验",
  "mRNA 序列设计与密码子优化",
  "全球流行株的群体多样性（本轮只用四个参考株）"
 ],
 "headline": [
  {
   "metric": "四型保守 9-mer 总数",
   "value": 152,
   "source": "work/results.json",
   "computed_by": "work/experiment.py (k-mer 集合交)",
   "recheck": {
    "by": "work/adversarial_check.py 独立重算集合交",
    "value": 152
   }
  },
  {
   "metric": "排除 ADE 区损失的保守表位数",
   "value": 7,
   "source": "work/results.json",
   "computed_by": "work/experiment.py",
   "recheck": {
    "by": "work/adversarial_check.py 换 padding 独立重算",
    "value": 7
   }
  },
  {
   "metric": "结构蛋白中的保守表位占比",
   "value": 0.05921052631578947,
   "source": "work/adversarial.json",
   "computed_by": "work/adversarial_check.py (按 UniProt 链段归属)",
   "recheck": {
    "by": "同脚本逐链计数汇总",
    "value": 0.05921052631578947
   }
  }
 ],
 "audit_command": [
  "/usr/bin/python3",
  "audit_delivery.py"
 ],
 "_outcome": {
  "H1": "成立（保守性压倒性真实）",
  "H2": "被推翻，且方向相反 —— ADE 区反而缺少保守表位",
  "critical": "94%% 保守表位在非结构蛋白，因此这批表位主要是 T 细胞靶点而非中和抗体靶点，这一点改变了 H2 结论的实际含义。"
 }
}