随附材料 · 边界与数据来源

边界(跑之前写死,跑完没有改过)

本轮选定的选项

提交方向是基于登革热病毒 4 个型别、从 ADE 效应入手设计 mRNA 通用疫苗。 提交人选定选项 2 = 在保守表位筛选基础上,加入「规避 ADE 相关增强表位」约束,看覆盖率被吃掉多少。

本轮做什么

UniProt 四个血清型参考多蛋白,穷举 9-mer / 15-mer 中四型逐字一致的保守表位; 排除 ADE 相关区域(prM 全链 + E 融合环,坐标取自注释与保守基序)后测覆盖率损失; 与 1000 次随机区域排除做对照;并统计保守表位在各蛋白上的分布。

明确不做

  1. MHC 结合力预测(保守 ≠ 能被递呈,属下一轮)
  2. 流行株群体多样性(本轮只用四条参考株 —— 最大外推限制)
  3. 免疫原性与动物实验
  4. mRNA 序列设计与密码子优化
  5. 穷尽文献报道的全部 ADE 增强表位

算力

纯 CPU,仅调用 UniProt 公开接口。

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