随附材料 · 边界与数据来源

边界(跑之前写死,跑完没有改过)

本轮选定的选项:提交人从我们给出的三个选项里选定选项一 —— 「选一个公开队列,先做『细胞随机划分 vs 患者分组划分』的对比,用同算力跑出分类器跨患者性能的差异」。

这一轮做什么

在一个非 HCC、非 PDAC 的实体瘤公开单细胞队列上,用同一个分类器、同一套超参、同样的算力预算, 比较两种划分方式给出的细胞状态分类性能:

这一轮明确不做

数据来源

GEO GSE72056(Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞 RNA-seq)。匿名游客可直接从 NCBI FTP 下载, 不需要申请、不需要 DUA。取其中 2840 个非恶性、且类型标注明确的细胞,来自 19 位患者, 六类:T 2040 / B 512 / Macro 119 / Endo 62 / CAF 56 / NK 51。

算力

纯 CPU,本机 4 核,总墙钟约 12 分钟。免费阶段不上 GPU。

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